توالیهای تکراری DNA

یک تکه ازتوالی  DNA به صورت ممتد اغلب چندین بار در DNA کل سلول تکرار می شود. برای مثال دنباله توالی DNA تنها یک قسمت کوچک از تلومر می باشد که در انتهای هر کروموزوم انسانی وجود دارد.

کل تلومر ، 15 کیلوباز است که ترکیبی از هزاران توالی تکراری “GGGTTA” می باشد.

به صورت تجربی ، تعداد کپیهای  تکرار شده را می توانند بر اساس کینتیکهای باز تشکیل DNA

(DNA reassociation kinetics) طبقه بندی نمود.

DNA کل در ابتدا به صورت تصادفی به  قطعاتی با سایز  متوسط 1000 جفت باز بریده می شود. بعد ازآن ، به آنها حرارت داده می شود تا رشته های  مکمل هر قطعه جدا شوند. سپس ، دما کاهش داده می شود تا رشته ها باز تشکل یابند. اگر قطعه ای دارای یک توالیی باشد که چندین بار در DNA کل تکرار شده باشد ، شانس زیادتری  در یافتن یک رشته مکمل برای آن وجود دارد و سریعتر از دیگر رشته ها که کمتر تکرار شده اند باز تشکیل میابد.

بر اساس درجه باز تشکیل ، توالیهای DNA به سه کلاس تقسیم می شوند:

• توالیهای تکرار بالا (Highly repetitive) : 10 تا 15 درصذ از توالیهای DNA را تشکیل می دهد که بسیار سریع باز تشکیل میابند.
• توالیهای تکرار متوسط (Moderately repetitive) : تقریبا 25 تا 40 درصد DNA پستانداران را تشکیل می دهد که باز تشکیل آن به طور میانه می باشد. این کلاس دارای تکرارهای پراکنده می باشد.
• توالی تک کپی (single copy) ( یا با کپیهای بسیار پایین) : این کلاس 50 تا 60 درصد از DNA پستانداران را تشکیل می دهد.

تکرارهای پشت سرهم - ستلایتها (ماهوارها) ، مینی ستلایتها (ماهوارکها) و میکروستلایتها ---(satellite)

تکرارهای پراکنده – LINEs و SINEs